Atelier 5 - Coronavirus et protéines...

Depuis le mois de décembre 2019, un nouveau coronavirus a commencé à
infecter l'homme: c'est le début d'une pandémie.
Ce coronavirus est appelé "Severe Acute Respiratory Syndrome-related
Coronavirus 2" (
SARS-CoV-2).
Il est responsable de la maladie appelée Coronavirus disease-19 (
COVID-19).
C'est le début d'une incroyable course contre la montre pour trouver des
traitements et des vaccins, le tout en s'appuyant sur des années de
recherche !
"We are learning so much, so fast !"
E. Hodcroft
Publication: Using bioinformatics
to hunt SARS-CoV-2, its variants & its origins – a practical guide
(2021)
Pour commencer:
un atelier (dès 11 ans) proposé
pour les Mystères de l'UNIL 2021: "la
chasse aux variants du coronavirus"
une
histoire et un atelier (dès 11 ans) sur le site
LightOfEvolution.org: "Chasse aux variants"

Pour aller plus loin (dès 15 ans)
: les liens ci-dessous donnent accès aux différents chapitres d'un
document pdf.
- C'est quoi un virus ?
- Des virus qui infectent l'homme
- SARS-CoV-2 et les autres coronavirus
- Activité: découvrir le génome de SARS-CoV-2
- Activité: tester la spécificité du test RT-PCR
- Activité: comparer les génomes de SARS-CoV-2 provenant
de diverses régions du monde et trouver les différences (mutations)
- Activité: découvrir les protéines de SARS-CoV-2
- Du gène à la protéine
- Activité: traduire la séquence du gène Spike en séquence de protéine
- A propos des vaccins à ARN.
- Du gène à la protéine
- La mutation N501Y
- Les mutations et les
variants Alpha, Beta, Gamma, Delta, Omicron....
- Activité: faire le lien entre une séquence d'acide aminé et la
structure 3D d'une protéine
- Activité: localiser la mutation N501Y dans la structure 3D
- Comprendre l'impact d'une mutation sur l'infectivité du virus
ou sa capacité à échapper à notre système immunitaire
- Activité: comparer la protéine Spike du
coronavirus de la civette, du pangolin et de la
chauve-souris
- Comprendre comment 'marche' un médicament ou le vaccin
- Activité: refaire les démarches
scientifiques des chercheurs du SIB
- Activité: rechercher des séquences de HIV
dans le génome de SARS-CoV-2