English version
Atelier 5 - Coronavirus et protéines...
Ce nouveau virus est appelé "Severe Acute Respiratory Syndrome-related Coronavirus 2" (SARS-CoV-2).
Il est responsable de la maladie appelée Coronavirus disease-19 (COVID-19).
C'est aussi le début d'une incroyable course contre la montre pour trouver des traitements et des vaccins, le tout en s'appuyant sur des années de recherche !
Objectifs:
- découvrir les virus et SARS-CoV-2
- découvrir des banques de données - GenBank (ADN), UniProtKB (protéine), PDB (structure 3D), Viralzone
- découvrir des outils bioinformatiques (Blast, BLAT, align, translate)
- mieux comprendre les démarches scientifiques des recherches en cours... et les défis !
Prérequis:
1.- Introduction
- Des virus ?- Des virus qui infectent l'homme ?
- SARS-CoV-2 et les autres coronavirus
2.- Le génome de SARS-CoV-2
- Le génome de SARS-CoV-2 -
Activité: comparer les génomes de SARS-CoV-2 provenant de différentes
régions du monde...
- La
spécificité du test PCR -
Activité: tester la spécificité des amorces utilisées pour la PCR...
3.- Les protéines de SARS-CoV-2
- Du génome aux protéines...- La protéine Spike de SARS-CoV-2
-
Activité: traduire la séquence du gène en séquence de protéine
-
Activité: de la séquence à la structure 3D de la protéine
- Comment
le virus pénètre dans les cellules humaines ?- Bande dessinée: Entrez donc !
4.- A la recherche de l'origine de SARS-CoV-2
- Les coronavirus infectent d'autres mammifères -
Activité: quel coronavirus est le plus similaire à SARS-CoV-2 ?
-
Activité: comparer la protéine Spike du coronavirus de la civette, du pangolin, de la
chauve-souris, ...
5.- A la recherche d'un traitement
- Médicaments ou vaccins ? -
vidéo: Médicaments
ou vaccins ?
6- SARS-CoV-2 et HIV
- Un exemple de fake news-
Activité: chercher des séquences de HIV dans le génome de SARS-CoV-2
7 - Dernières nouvelles
- A propos des vaccins à ARNm (BioNTech/Pfizer et Moderna)- A propos du variant anglais (B.1.1.7)
- A propos du variant Sud Africain (501Y.V2)
- A propos du variant brésilien (P1, P.1 ou P.1.1.28.1)
Lien pour les activités en classe
Nous contacter...
Cet atelier est issu d'une collaboration entre L'éprouvette, laboratoire public de l'Université de Lausanne (Service Culture et Médiation Scientifique) et le groupe Swiss-Prot - SIB Swiss Institute of BioinformaticsCet atelier est prévu pour être animé dans les classes ou virtuellement: n'hésitez pas à nous contacter !
- outreach@sib.swiss
En savoir plus sur nous...
Licence et mentions légales
- This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.