(2) Traduit la séquence ADN avec
l'aide de l'ordinateur en utilisant: http://web.expasy.org/translate/
(Choisit l'option 'Verbose' (pour avoir le code 3
lettres), puis l'option 'Compact' (pour avoir le code 1 lettre)
Recopie les 10 premiers acides aminés et compare avec tes résultats
précédents: .................................. (Truc: ta séquence (en rose) se
trouve dans le 'Frame 1')
Pour les experts: il existe
plusieurs codes génétiques (http://web.expasy.org/translate/)
Combien de codes génétiques différents ?
.................................................
(#2) Identifie la protéine inconnue en
comparant la séquence que tu as obtenue avec les séquences de protéines qui
se trouvent dans une banque de données ...
(1) Essaye de le faire manuellement
en comparant la séquence en acide aminé que tu as obtenue avec les séquences
présentes sur les différentes fiches
Banque de données de protéines (pdf) Truc: utilise Crtl F
pour trouver la séquence d'acides aminés dans le document....
(2) Essaye de le faire avec
l'aide de l'ordinateur et utilise un outil bioinformatique appelé
BLAST
-> Fais un BLAST @ http://www.uniprot.org/blast
contre la banque de données UniProtKB/Swiss-Prot (copier coller la séquence en acide aminé dans la boîte 'Protein
sequence', sélectionner 'Target database' = UniProtKB/Swiss-Prot, puis
cliquer sur le bouton 'Run BLAST')
Cette protéine s'appelle :...........................
De quel organisme ?: .......................
Pour les experts: de combien
d'acides aminés est-elle composée ?.............................
Chercher des informations sur cette protéine dans wikipedia:
Quelle est sa fonction ?............................
Toujours avec
l'aide de Blat @ UCSC :
Vérifie que la séquence ADN imprimée dans le livre 'Chromosome 21' est
bien une séquence qui se trouve sur le chromosome 21 humain....
Truc: taper au moins 30 lettres....
Photo d'une page du livre (1500 pages, 48'000'000 de lettres ADN):
*****
Toujours avec
l'aide de Blat @ UCSC:
La police scientifique utilise cette séquence ADN pour identifier le sexe
d'un suspect.
Vérifie que cette séquence ADN n'est retrouvée que sur le chromosome Y:
atgcaatcatatgcttctgctatgttaagcgtattc
Retrouves-tu cette séquence ADN sur un chromosome du chimpanzé (chimp) ?
Si oui, lequel ? ................. -
les chromosomes du chimpanzé (caryotype): combien de chromosomes ?
......
Retrouves-tu cette séquence ADN sur un chromosome du chat (cat) ? Si oui,
lequel ?..................... -
les chromosomes du chat (caryotype): combien de chromosomes ? ......
Retrouves-tu cette séquence ADN sur un chromosome du poulet (chicken) ? Si
oui, lequel ?.....................
- les
chromosomes du poulet (caryotype): combien de chromosomes ? ......
*****
Tape au hasard une séquences ADN longue de 30 lettres (avec les 4
lettres A, T, G, C) : la retrouves-tu chez une espèce ?
*********************************************************************************
(#5) Une introduction à la classification des espèces (phylogénie)...
Peux-tu deviner quelle séquence (A ou B) appartient au poulet et
laquelle appartient au cochon ?
HUMAN MALWMRLLPLLALLALWGPDPAAAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKTRREAED A MALWTRLLPLLALLALWAPAPAQAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREAEN B MALWIRSLPLLALLVFSGPGTSYAAANQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYSPKARRDVEQ **** * *******.: .* .: * .************************:**:**:.*:
Qui est le 'cousin' du tyranosaure ?
- Tu peux découvrir qui a un ancêtre commun avec le tyranosaure en
construisant un arbre phylogénétique avec les séquences de collagène
Qui est le 'cousin' du dodo et du mammouth ?
- Tu peux découvrir qui a un ancêtre commun avec le dodo ou le mammouth en
construisant un arbre phylogénétique avec les séquences du cytochrome
B
Qui est le 'cousin' du concombre ?
- Tu peux découvrir qui a un ancêtre commun avec le concombre en
construisant un arbre phylogénétique avec les séquencesRécepteur à l'éthylène
A toi de déterminer à quelle espèce appartient les différentes séquences
d'ADN et de deviner de quelle ville il s'agit (campagne, montagne ou bord de
mer)....
Manuellement: Banque
de données Métagénomique Urbaine Truc: les séquences ADN sont classées dans
l'ordre alphabétique... Truc: utilise Crtl F pour trouver les
lettres dans le documents....
****
(#8) Le gâteau d'anniversaire mystérieux (Nuit des Musées 2017)
Vanille, cacao, noix de coco: identifie les différentes espèces qui se
cachent dans un gâteau d’anniversaire grâce à l’information contenue au cœur
de leur ADN !
Manuellement: Banque
de données Métagénomique Gâteau Truc: les séquences ADN sont classées dans
l'ordre alphabétique... Truc: utilise Crtl F pour trouver les
lettres dans le documents....
(#9) La pizza métagénomique
Combien d'espèces différentes dans une pizza ?
Rendez-vous sur l'atelier
Pizza métagénomique
**** (#10) Enquête policière
Un verre contenant un liquide blanchâtre a été retrouvé sur les lieux d'un
crime. Des experts ont analysé ce liquide et séquencé les protéines qui s'y
trouvaient. A toi d'identifier ces protéines et de découvrir peut-être la
cause du décès !
Voici les séquences (fragments) des protéines qui ont été retrouvées dans le
liquide.
***********************************************************************************
(#11) Es-tu devenu un expert en ADN, protéine et bioinformatique ?www.chromosomewalk.ch