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Atelier 7 - Portrait-robot 'bioinformatique' de la titine

Les protéines sont composées en moyenne de 300 acides aminés: la titine, une protéine du muscle, en contient 34'350 !
 

La dimension extrême de la titine a donné du fil à retordre aux bioinformaticiens. Pourquoi? Lorsqu'on a voulu dresser une sorte de "portrait-robot" de la titine (calcul du nombre d'acides aminés, du poids, du nombre d'atomes, régions répétées...), les programmes informatiques existants - conçus pour analyser des protéines de taille "standard" - étaient incapables de gérer une aussi grande protéine. Et lorsqu'on introduisait la séquence en acide aminé de la titine dans ces programmes, ils se plantaient tout simplement !


Portrait-robot 'bioinformatique' de la titine. Quels programmes résistent à la taille de ce colosse ?

Voici la séquence en acides aminés de la titine (copier / coller dans le différents programmes)

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